Museum Perjuangan Yogyakarta (bahasa Jawa: ꧋ꦩꦸꦱꦾꦶꦪꦸꦩ꧀ꦦꦼꦂꦗꦸꦮꦔꦤ꧀ꦔꦪꦺꦴꦒꦾꦏꦂꦠ꧉code: jv is deprecated , translit. Musiyum Perjuwangan Ngayogyakarta) adalah museum yang memiliki koleksi mengenai perjuangan bangsa Indonesia. Museum ini terletak kurang lebih 2 kilometer dari pusat Kota Yogyakarta. Saat ini, Museum Perjuagan Yogyakarta berada dalam naungan Museum dan Cagar Budaya, Kementerian Kebudayaan Republik Indonesia.